Historická podsbírka je dále členěna dle charakteru předmětů.
Podsbírka historická
Většina předmětů podsbírky historické pochází z měst a obcí, které v současnosti patří nebo v minulosti patřily do okresu Strakonice. Další část předmětů je z jižních Čech a malá část pochází z dalších oblastí Čech a Moravy. Některé předměty mají svůj původ v ostatních státech světa. Sbírkové předměty v podsbírce historické dokumentují období od středověku do současnosti. První předměty podsbírky historické byly do sbírky muzea zařazeny již v 90. letech 19. století, kdy byl vytvořen odbor pro Národopisnou výstavu, který začal shromažďovat zajímavé předměty. Ve dvacátých a třicátých letech 20. století byly sbírkové předměty získávány dary místních občanů a rodáků, peněžních ústavů, průmyslových podniků, spolků a živnostenských společenstev, sběry členů muzejního spolku a koupí. Po 2. světové válce byla podsbírka historická doplňována dary občanů a rodáků z okresu Strakonice, dary ONV a národních výborů, obchodních organizací, průmyslových podniků, společenských organizací, zemědělských družstev a podniků, sběry pracovníků muzea a koupí.
Podsbírka historická je podle charakteru předmětů rozdělena do několika tematických částí:
Domácnost – dečky, hračky, kosmetické potřeby, ozdoby do vlasů, předměty na praní prádla, předměty na šití a vyšívání, svítidla, šperky a bižuterie, zapalovadla a žehličky.
Hodiny – hodiny, hodinové strojky.
Hudební nástroje – tato část historické podsbírky obsahuje více než 160 kompletních hudebních nástrojů a několik desítek jejich částí. Většinu sbírkových předmětů tvoří dudy. Strakonické muzeum má největší dudáckou sbírku ve střední Evropě, kterou se snaží koncepčně dále rozšiřovat.
Keramika – předměty z fajánse, hlíny, kameniny, majoliky, porcelánu a terakoty.
Kuchyňské potřeby – formy na pečení, nádobí, kuchyňské nástroje, mlýnky, příbory, vařiče, kuřácké potřeby.
Loutky – loutky z divadla M. Kopeckého, rodiny Lagronů, z Loutkové scény Radost.
Míry a váhy – míry, váhy, závaží.
Nábytek – lidový malovaný nábytek z 19. století (skříně, truhly), kuchyňský nábytek, křesla, židle, stoly, skříně, skříňky, postele, prádelníky, školní lavice, cechovní truhly z 19. a 20. století.
Oděvy, oděvní doplňky – obsahují lidové kroje a jejich součásti z různých oblastí Československa, ale i lidové kroje z dalších evropských zemí s ohledem na dudáckou tradici, kroje známých dudáků včetně skotského kroje s tartanovým vzorem schváleným pro ČR, motoristické oděvy závodníků ČZ, dámské šaty, pánské šaty, kabáty a dětské oblečení z 20. století, spolkové kroje (kroj Sokola, kabát Jednoty K. H. Borovského), uniformy, koutnice, spodní oblečení, košile, fezy a jiné pokrývky hlavy, vějíře, deštníky, opasky, pánská a dámská obuv.
Textil – materiály textilního charakteru jako háčkované dečky, vzorníky háčkování, pamětní šátky na různé události z 19. a 20. století, spolkové prapory, řeznický přehoz na rakev, dečky na stěnu, závěs na oltář do synagogy, samostatné vzorky látek vyráběné ve Fezku Strakonice, dále vzorníky látek, barevnice a vzorníky přízí.
Psací potřeby
Sakrální předměty – kropenky, kříže, obrazy, růžence, sochy, svícny.
Sklo – misky, poháry, sklenice, svícny, talířky, vázy.
Společenské dějiny – předměty vztahující se k dějinám průmyslových podniků, spolků, společenských organizací, významných událostí.
Venkovské předměty – nádoby, nástroje, zemědělské nářadí.
